负责全市地表水生态环境监管工作；负责拟订和监督实施重点流域生态环境规划、饮用水水源地生态环境规划和水功能区划；负责组织测算并确定地表水环境容量，开展水环境承载力评估；负责建立和组织实施重点流域水体断面水质考核制度；承担水污染物总量控制、排污许可证审核、水污染物排污权交易具体工作；负责指导入河排污口设置和综合协调入河排污口日常监管工作，负责统筹协调跨行政区域的流域各地、各部门水污染防治工作，推进辉发河等重点流域水污染治理项目的实施；承办涉及本科室职责方面的人大、政协提（议）案工作；完成局党组交办的其他工作。